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【曬曬咱的國(guó)之重器14】短視頻丨國(guó)家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心

發(fā)布時(shí)間:2022-01-04 16:24:00來(lái)源: 光明網(wǎng)

  【曬曬咱的國(guó)之重器14】

  細(xì)菌、病毒、真菌、支原體、衣原體……

  談及它們,你定會(huì)避之不及。但是,你知道嗎?在地球生物圈,它們占據(jù)著重要位置——環(huán)境、食品、醫(yī)藥、健康、工業(yè)、農(nóng)業(yè)、化學(xué)化工、材料、生物安全,與人類(lèi)存續(xù)相關(guān)的所有環(huán)節(jié),幾乎都與它們有關(guān)。其家族成員還包括放線菌、立克次氏體、螺旋體……它們,都是微生物。

  微生物研究,是科技界持續(xù)關(guān)注的熱點(diǎn),也正因此,微生物科學(xué)數(shù)據(jù)成為一種重要戰(zhàn)略資源。

  2019年6月,作為我國(guó)首批啟動(dòng)的20個(gè)國(guó)家科學(xué)數(shù)據(jù)中心之一,依托中科院微生物研究所,與中國(guó)疾控中心傳染病所、中科院海洋所、中科院上海植物生理生態(tài)研究所、中科院計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)信息中心等單位共建的國(guó)家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心,開(kāi)始承擔(dān)起保存、整合、挖掘、利用微生物科學(xué)數(shù)據(jù)的重大使命。

  模式微生物、基因序列、標(biāo)本、菌種……從開(kāi)始的自有數(shù)據(jù)共享,到如今,國(guó)家科技計(jì)劃匯交數(shù)據(jù)、期刊數(shù)據(jù)、華大基因等測(cè)序公司數(shù)據(jù)源源不斷地匯集,你能想象嗎?這里,已匯集數(shù)據(jù)條數(shù)超過(guò)40億、3PB;這里,已成為我國(guó)最重要、在世界上有極大影響力的微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心。

  不僅如此,國(guó)家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心還制定了第一個(gè)微生物數(shù)據(jù)領(lǐng)域的國(guó)際ISO數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn),覆蓋資源、物種、組學(xué)、功能等方面的數(shù)據(jù)管理與發(fā)布。他們還在此基礎(chǔ)上開(kāi)發(fā)了擁有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的數(shù)據(jù)管理平臺(tái),在國(guó)內(nèi)外上百家單位使用。

  中心主任、中科院微生物所研究員馬俊才時(shí)常會(huì)被問(wèn)到這樣一個(gè)問(wèn)題:“國(guó)際上已經(jīng)有GENBANK、GISAID等比較知名的微生物數(shù)據(jù)庫(kù),如果科學(xué)是無(wú)國(guó)界的,為什么我們還要建立自己的數(shù)據(jù)庫(kù)?”

  馬俊才的回答總是耐心而堅(jiān)定——

  “國(guó)家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心與這些數(shù)據(jù)庫(kù)從來(lái)不是非此即彼的關(guān)系,它的建立,既是為了保障國(guó)家微生物數(shù)據(jù)主權(quán),也是為了依法依規(guī)推動(dòng)數(shù)據(jù)共享和國(guó)際交流。”

  馬俊才說(shuō),目前幾家比較大的數(shù)據(jù)庫(kù)均在國(guó)外,數(shù)據(jù)收錄和公布的流程比較復(fù)雜、時(shí)間比較長(zhǎng),有些數(shù)據(jù)庫(kù)的下載還要收費(fèi)。

  “我們國(guó)家財(cái)政支持的科研所產(chǎn)生的數(shù)據(jù),中國(guó)科學(xué)家使用還得給別人交錢(qián),這合理嗎?”

  好消息來(lái)了!馬俊才說(shuō),作為國(guó)家科技資源共享服務(wù)平臺(tái),中心數(shù)據(jù)資源全部免費(fèi)共享,“這從某種程度上解決了我國(guó)科學(xué)家不能使用我國(guó)數(shù)據(jù)的窘境”。

  有了科學(xué)數(shù)據(jù),還要讓數(shù)據(jù)“活”起來(lái)——

  國(guó)家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心在數(shù)據(jù)的加工整理和分析挖掘上下了大功夫。馬俊才說(shuō),他們以國(guó)家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心為依托,與國(guó)家食品安全領(lǐng)域開(kāi)展合作,建立了國(guó)家食源性致病微生物全基因組數(shù)據(jù)庫(kù)及溯源網(wǎng)絡(luò),對(duì)31個(gè)省區(qū)市的60種食品基質(zhì)、9000株細(xì)菌、500株真菌、500株病毒的菌種進(jìn)行測(cè)序,并建立了相應(yīng)的大數(shù)據(jù)平臺(tái)和應(yīng)用系統(tǒng),保障國(guó)家食品安全。

  接下來(lái)的目標(biāo)是什么?馬俊才說(shuō):“我們也在不斷提升自己的能力和國(guó)際影響力,建立更多數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)、牽頭國(guó)際重大合作計(jì)劃,爭(zhēng)取吸引更多國(guó)內(nèi)、國(guó)際科學(xué)家把科學(xué)數(shù)據(jù)提供給我們,建立更多具有國(guó)際權(quán)威的微生物數(shù)據(jù)庫(kù)?!?/p>

 ?。?022年01月04日 01版)

  監(jiān)制:張寧 廖慧

  策劃:李方舟 李宜蒙

  配音:張悅鑫

  剪輯:董大正

  制作:光明網(wǎng)新聞中心

  采訪:光明日?qǐng)?bào)全媒體記者 齊芳

(責(zé)編: 常邦麗)

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