中國(guó)科研人員揭秘全球首個(gè)牧草領(lǐng)域圖形泛基因組
中新社成都3月3日電 (記者 賀劭清)記者3日從四川農(nóng)業(yè)大學(xué)獲悉,該校草業(yè)科技學(xué)院黃琳凱教授團(tuán)隊(duì)構(gòu)建了全球首個(gè)牧草領(lǐng)域圖形泛基因組——美洲狼尾草圖形泛基因組,并揭示了狼尾草耐熱的分子機(jī)制。
這一研究成果于北京時(shí)間3日以《Pangenomics identifies structural variation associated with heat tolerance in pearl millet》為題在國(guó)際權(quán)威學(xué)術(shù)期刊《自然遺傳學(xué)》(Nature Genetics)在線發(fā)表。
美洲狼尾草又名珍珠粟,全球種植面積約達(dá)3100萬公頃。在中國(guó),美洲狼尾草是重要的飼草、飼料。在非洲等熱帶干旱地區(qū),美洲狼尾草是重要的雜糧作物。
2019年,黃琳凱教授團(tuán)隊(duì)首次公布了鴨茅的高質(zhì)量參考基因組,是中國(guó)公布的首個(gè)牧草參考基因組。隨著研究的深入以及技術(shù)的進(jìn)步,構(gòu)建高質(zhì)量的圖形泛基因組成為黃琳凱教授團(tuán)隊(duì)的重要目標(biāo)。
通過聯(lián)合國(guó)內(nèi)外多家單位,本次研究從全球8個(gè)地區(qū)收集的394份美洲狼尾草核心種質(zhì)中選取10份代表性材料,進(jìn)行基因組從頭組裝,獲得了高質(zhì)量的基因組組裝序列,結(jié)合一個(gè)已發(fā)表的基因組構(gòu)建了首個(gè)美洲狼尾草圖形泛基因組。
當(dāng)前,全球氣候變暖嚴(yán)重威脅世界糧食安全。解析植物的耐熱機(jī)制,從而改良植物耐熱性,培育耐高溫的農(nóng)作物是目前重要的育種目標(biāo)之一。
起源于非洲的美洲狼尾草,能夠適應(yīng)極端高溫的氣候,是研究植物耐熱機(jī)制的優(yōu)良材料。本次研究通過對(duì)水稻、玉米、高粱等多個(gè)物種進(jìn)行比較基因組學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)美洲狼尾草中擴(kuò)張的RWP-RK轉(zhuǎn)錄因子家族和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)相關(guān)基因協(xié)同參與耐熱性調(diào)控,挖掘并驗(yàn)證到關(guān)鍵結(jié)構(gòu)變異和調(diào)控候選基因3個(gè),其中基因PMF0G00024.1(RWP-RK)在水稻中過表達(dá)也顯著提高了耐熱性,將為分子育種提供重要靶點(diǎn)。(完)
版權(quán)聲明:凡注明“來源:中國(guó)西藏網(wǎng)”或“中國(guó)西藏網(wǎng)文”的所有作品,版權(quán)歸高原(北京)文化傳播有限公司。任何媒體轉(zhuǎn)載、摘編、引用,須注明來源中國(guó)西藏網(wǎng)和署著作者名,否則將追究相關(guān)法律責(zé)任。
- 山西中陽:搬出的是生活 溢出的是幸福
- 6項(xiàng)入選 山西公布2022年度重要考古發(fā)現(xiàn)
- 山西霍州窯近50年首次發(fā)掘:有金元窯址遺存
- 如何區(qū)分甲流和感冒?這種情況需就醫(yī)
- 專家提示老年人應(yīng)做好帶狀皰疹病毒預(yù)防
- 2023年全國(guó)兩會(huì)調(diào)查結(jié)果出爐 教育人才、社會(huì)保障、正風(fēng)反腐最受網(wǎng)友關(guān)注
- 央行:從四方面為經(jīng)濟(jì)平穩(wěn)健康發(fā)展提供有力金融支持
- 央行:2022年普惠小微貸款余額近24萬億元
- 微視頻:2023年全國(guó)兩會(huì)調(diào)查結(jié)果出爐
- 容易委員:我國(guó)新一代載人運(yùn)載火箭2027年前后首飛 可將登月飛船送入奔月軌道