輸入疾病信息即可找到靶點AI生成蛋白質(zhì)平臺來了
◎本報記者 付麗麗
“輸入一個病人,比如一個胃癌病人疾病相關(guān)的多組學(xué)數(shù)據(jù),AIGP平臺即能夠分析這些數(shù)據(jù),找到針對這個胃癌病人的靶點,根據(jù)這個靶點生成一個抗體甚至一系列多樣性的蛋白質(zhì)。最后,一鍵式生成的蛋白質(zhì)還可以回到自動實驗室里進行合成及功能驗證?!?月31日,百圖生科(北京)智能技術(shù)有限公司(以下簡稱百圖生科)CTO宋樂向科技日報記者介紹。百圖生科基于生命科學(xué)大模型驅(qū)動的AIGP平臺于日前正式發(fā)布。
宋樂介紹,上面所說的只是AIGP平臺的功能之一,其還可以根據(jù)形狀及理化性質(zhì)需求,生成一系列滿足需求的蛋白質(zhì);再就是根據(jù)一個蛋白質(zhì)靶點生成對應(yīng)的和靶點結(jié)合的蛋白質(zhì),比如可以針對新冠病毒生成一個蛋白質(zhì),甚至可以針對石油相關(guān)的分子生成一個酶。
據(jù)了解,過去兩年多,百圖生科構(gòu)建了生命科學(xué)領(lǐng)域千億參數(shù)的跨模態(tài)大模型“xTrimo”。該大模型從跨物種、跨模態(tài)的生命信息中學(xué)習(xí)蛋白質(zhì)如何構(gòu)成和實現(xiàn)功能、如何相互作用、如何組合和調(diào)控細胞功能的關(guān)鍵規(guī)律,從而破解生命的自然語言——蛋白質(zhì)。基于大模型,AI在一系列任務(wù)算法上取得了明顯的進展,除了能更好地完成結(jié)構(gòu)預(yù)測等基礎(chǔ)任務(wù)外,也開始可以根據(jù)不同的問題,設(shè)計新的蛋白質(zhì),回答各種生命科學(xué)問題。
目前,AIGP平臺設(shè)置了3類功能模塊,分別是F2P(根據(jù)結(jié)構(gòu)、功能、可開發(fā)性等功能指標(biāo)設(shè)計/優(yōu)化蛋白質(zhì))、P2P(給定抗原等目標(biāo)蛋白質(zhì),設(shè)計與之以特定方式結(jié)合的抗體等蛋白質(zhì)),以及C2P(給定細胞,發(fā)現(xiàn)調(diào)控細胞功能的靶點蛋白質(zhì)并設(shè)計相應(yīng)的調(diào)控蛋白質(zhì))。
此前,AIGP平臺已經(jīng)進行了一段時間的內(nèi)部測試,在創(chuàng)新免疫調(diào)控藥物ImmuBot的研發(fā)中,貢獻了多個高性能彈頭、新功能傳感器的研發(fā)案例。
中國科學(xué)院院士、著名免疫學(xué)家董晨教授認為,AI之所以能夠解決問題,就是通過對大數(shù)據(jù)的分析和進一步的演繹與應(yīng)用。
宋樂也表示,當(dāng)前,根據(jù)不同模塊的輸入和要求,AIGP平臺可在較短時間內(nèi)設(shè)計和生成具有特定性質(zhì)的蛋白質(zhì)。今年6月起,其部分功能模塊將進一步開放,讓專業(yè)用戶可以直接自主使用,在更多的研究場景調(diào)用AI的蛋白質(zhì)生成能力,激發(fā)更多的生命科學(xué)探索。
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